锦州副将施大勇识破贼首诡计，及时领军赶到平叛。战斗中，辽东参将祖大弼、游击吴三桂不幸阵亡。

奏疏中，高起潜向天子请罪，说他未能识明贼逆诡计，险些酿成大祸，又造成祖大弼和吴三桂阵亡，实在罪不可恕，恳请天子从重责罚。但同时他又说自己居中运筹，不畏贼军亲自督阵，指挥锦州军及京营、蓟镇各家兵马齐心协力平叛，这才将叛乱及时平定下去。

至于对先前他上报锦州军谋叛之事，高起潜也同时予以说明，说是为了早日平定叛军，这才和施大勇暗中商议，谎称锦州军谋叛，以使叛军不生提防之心，从而可以让锦州军抽兵出来奇袭登州，一举端掉叛军老巢，使叛军人心顿去，兵无战志，一战而定大局。为防此计泄漏，让叛军有了准备，所以这才冒着欺君之罪连朝廷也瞒了。现在事定，也请皇上治他欺君之罪。

请罪是请罪了，欺君之罪也认了下来，高起潜这注下得实在是太大，别的先不说，仅是这欺君之罪只怕也能让他人头落地了。但他偏偏就不怕，因为他太了解紫禁城中年轻的天子了。如果他在登莱一无所获，那这欺君之罪肯定是坐实，天子一怒之下定会砍了自己。现在嘛，有平叛大功在手，天子万万不会治他这大功臣的。当然，让高起潜敢于自认欺君的最大缘故怕还是文华殿那番争论吧。为防万一，高起潜还是拿出几万两银子进京打点了，司礼掌印王德化肯定是要打点好的，秉笔太监王承恩也是不能落下，其余司礼监诸人连同皇帝身边的御前太监也都是一个都不能落的。

同时送上京的还有兵部主事张国臣的奏表，大致内容和高起潜他们的上疏差不多。莱州城中的通州总兵杨御蕃也上疏证实李孔二逆诈降复叛被杀。

施大勇也上疏称虽贼首李九成和孔有德已被斩杀，但叛军余部仍有多股活动于登莱境内，为保地方安靖，不使贼寇复起，锦州军正不遗余力的对叛军余部进行征剿。同时又请朝廷暂将登州作为锦州军暂驻之地，待登莱叛军彻底